Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax9P47242 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms