Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VhlP40338 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
VhlP40338 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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