Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rab20P35295 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rab20P35295 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rab20P35295 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rab20P35295 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rab20P35295 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rab20P35295 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rab20P35295 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rab20P35295 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab20P35295 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rab20P35295 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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