Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nedd1P33215 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nedd1P33215 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nedd1P33215 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nedd1P33215 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nedd1P33215 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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