Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms