Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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