Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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