Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms