Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxd10P28359 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxd10P28359 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxd10P28359 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxd10P28359 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd10P28359 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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