Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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