Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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