Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms