Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfkb1P25799 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms