Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NdnP25233 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
NdnP25233 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NdnP25233 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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