Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms