Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms