Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RarbP22605 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RarbP22605 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RarbP22605 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RarbP22605 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RarbP22605 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RarbP22605 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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