Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SftpcP21841 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SftpcP21841 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms