Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TP20293 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TP20293 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TP20293 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TP20293 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TP20293 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TP20293 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TP20293 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TP20293 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TP20293 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TP20293 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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TP20293 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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TP20293 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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TP20293 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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TP20293 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TP20293 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TP20293 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TP20293 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TP20293 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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