Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PcnaP17918 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PcnaP17918 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PcnaP17918 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PcnaP17918 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PcnaP17918 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PcnaP17918 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PcnaP17918 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PcnaP17918 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PcnaP17918 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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