Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp1P11438 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp1P11438 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms