Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp1P11103 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp1P11103 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Parp1P11103 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp1P11103 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp1P11103 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp1P11103 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Parp1P11103 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp1P11103 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp1P11103 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp1P11103 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp1P11103 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms