Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P10404 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P10404 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P10404 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P10404 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P10404 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P10404 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P10404 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P10404 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P10404 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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P10404 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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P10404 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P10404 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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