Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06323 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06323 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06323 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06323 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06323 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06323 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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