Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01648 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01648 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01648 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01648 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01648 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01648 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01648 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01648 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01648 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01648 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms