Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ifnb1P01575 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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