Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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