Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BlmO88700 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BlmO88700 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BlmO88700 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BlmO88700 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BlmO88700 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BlmO88700 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BlmO88700 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BlmO88700 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BlmO88700 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BlmO88700 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms