Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops6O88545 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms