Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms