Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChkaO54804 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChkaO54804 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms