Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2bO35690 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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