Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms