Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn9O35239 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ptpn9O35239 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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