Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Smad6O35182 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smad6O35182 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smad6O35182 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smad6O35182 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smad6O35182 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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