Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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