Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms