Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CckarO08786 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CckarO08786 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CckarO08786 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CckarO08786 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CckarO08786 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CckarO08786 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CckarO08786 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CckarO08786 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CckarO08786 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CckarO08786 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CckarO08786 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 322.3 ms