Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MsmbO08540 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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