Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms