Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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BC024978J3QPC3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC024978J3QPC3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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