Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms