Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm29394H3BIW7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm29394H3BIW7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm29394H3BIW7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm29394H3BIW7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm29394H3BIW7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm29394H3BIW7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm29394H3BIW7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm29394H3BIW7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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