Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vmn1r34G3XA52 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vmn1r34G3XA52 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms