Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx1-1G3UXB3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx1-1G3UXB3 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms