Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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