Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M1F7CXU4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M1F7CXU4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M1F7CXU4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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H2-M1F7CXU4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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H2-M1F7CXU4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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