Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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