Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm20518E9Q548 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20518E9Q548 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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