Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap11-1E9Q2E9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms